Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB10P61026 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB10P61026 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB10P61026 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB10P61026 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB10P61026 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB10P61026 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB10P61026 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB10P61026 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB10P61026 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB10P61026 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB10P61026 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB10P61026 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB10P61026 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB10P61026 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB10P61026 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB10P61026 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB10P61026 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB10P61026 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB10P61026 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB10P61026 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB10P61026 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB10P61026 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB10P61026 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms