Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPCS3P61009 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms