Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVFC1-1P60608 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms