Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL3P58215 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms