Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH15P55291 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms