Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKAA2P54646 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms