Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCR4P51679 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCR4P51679 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCR4P51679 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCR4P51679 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms