Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC1P48995 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms