Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP5P45974 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP5P45974 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP5P45974 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP5P45974 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP5P45974 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms