Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5CP41229 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms