Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms