Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD13P35453 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms