Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF2P35227 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms