Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTGER1P34995 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms