Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP1P30622 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms