Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms