Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLD1P28340 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLD1P28340 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms