Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms