Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSSP25774 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTSSP25774 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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