Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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