Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XBP1P17861 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XBP1P17861 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
XBP1P17861 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XBP1P17861 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms