Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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