Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ZNF888P0CJ79 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ZNF888P0CJ79 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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