Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms