Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPBP07199 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms