Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POP4O95707 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POP4O95707 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POP4O95707 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms