Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms