Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC22BO75396 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms