Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PRAMEF10O60809 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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PRAMEF10O60809 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PRAMEF10O60809 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PRAMEF10O60809 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PRAMEF10O60809 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF10O60809 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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