Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMPRSS11DO60235 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms