Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CXCL13O43927 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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