Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALUO43852 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALUO43852 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALUO43852 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALUO43852 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALUO43852 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALUO43852 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALUO43852 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALUO43852 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms