Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFS4O43181 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms