Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP17L12C9JPN9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms