Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms