Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOBPA7XYQ1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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