Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRRM4A7MD48 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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