Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FRMD3A2A2Y4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms