Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F8A0AVK6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms