Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIAS3Q9Y6X2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIAS3Q9Y6X2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms