Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms