Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms