Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP20Q9Y2K6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms