Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL5

PRR12, Proline-rich protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR12Q9ULL5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRR12Q9ULL5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms