Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms