Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms