Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC4Q9UBN4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms