Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFIP11Q9UBB9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFIP11Q9UBB9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms