Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC88CQ9P219 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms