Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CCDC180Q9P1Z9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms